Gıda intoleransı ve gıda alerjisinin yol açtığı semptomlar başka klinik durumlarda da görülebileceğinden bu şikayetlerin olduğu vakalarda, öncelikle uzman hekim tarafından detaylı bir araştırma yapılıp diğer durumlar ekarte edildikten sonra gıda alerjisi veya intoleransı araştırılmalıdır. Sindirim ve emilim bozuklukları düzeldiğinde, alınan gıdanın neden olduğu problem de ortadan kalkacaktır. Sindirim sorununu çözmek her zaman çok kolay olmayabilir. Fiziksel, duygusal, hatta ruhsal nedenler araştırılmalı ve tedavi edilmelidir. Sindirim veya emilim bozukluğuna yol açabileceği düşünülen özgül gıdalar diyetten uzaklaştırılarak vücudun bunlarla mücadele etmesi önlenir. Böylece vücut üzerindeki stres hafifler. Bazen vücudun dışarıdan desteğe ihtiyacı vardır. O zaman yaşam tarzında ve diyet içeriğinde değişiklikler, dinlenme, tıbbi tedavi, besinle alınan bazı maddelerin dışardan takviyesi gerekebilir.