Endometriozisde uygulanan tıbbi tedavilerin ağrıyı gidermede etkili olduğu ancak infertilite üzerinde olumlu bir etkisinin olmadığı bilinmektedir. Bu nedenle kısırlık sebebi ile başvuran hastalarda tıbbi tedavi önerilmez. Dolayısıyla bazı seçilmiş vakalar dışında hastanın yumurtalık rezervini dahada kötüleştiren cerrahi operasyonlardan kaçınılmalıdır. Kısırlık nedeniyle tedavi edilen bir kadın cerrahi sonrası 6 ay içinde kendiliğinde hamile kalamamış ise ve tüpler açık ise aşılama denenebilir.