Ergenekon Davası'nda 86 sanık şu suçlarla yargılanıyor.
* Silahlı terör örgütüne üye olmak,
* Silahlı terör örgütüne yardım etmek,
* Türkiye Cumhuriyeti Hükümeti'ni ortadan kaldırmak veya görev yapmasını engellemeye teşebbüs,
* Hükümete karşı halkı silahlı isyana tahrik,
* Patlayıcı madde bulundurmak ve bu suçları azmettirmek,
* Danıştay saldırısına ve Cumhuriyet gazetesine patlayıcı madde atmak suçlarına azmettirmek,
* Devletin güvenliğine ilişkin gizli belgeleri temin etmek, kişisel verileri kaydetmek,
* Askeri itaatsizliğe teşvik,
* Halkı kin ve düşmanlığa alenen tahrik.