HAŞİMATO hastalığını şiddetli geçirenlerde, kandaki tiroid antikor seviyesi çok yüksek olanlarda beyin iltihabı (ensefalit) de görülebilir. Bu hastalarda unutkanlık, konsantrasyon bozukluğu, dalgınlık, algılama ve anlama yeteneğinde azalma, sinirlilik, panik atak görülebilir.