Üniversitesini holding gibi yönettiği iddia edilen Önce'nin koyun otlatarak, öğrencilerden para toplayarak üniversitenin döner sermaye gelirini 25 bin YTL'ye çıkarttığı belirtiliyor. Hafta sonları İzmir'e gitmek için üniversite vakfının kaynaklarını kullanmasının yanı sıra 135 bin TL'ye makam aracı aldığı ortaya çıkan Önce'nin gizemli uygulamaları da dikkat çekiyor. Rektör Önce, 8 Nisan 2005'te, kendi imzasıyla öğretim üyelerine yazdığı talimatnamede, "Özel kaleme benimle ilgili sorular sorulmasın. Randevu almadan kapıma gelmeyin" diyor.