Erkek kısırlığının yüzde 2'si hormon bozukluklarına bağlıdır. Hipotalamus ve hipofiz gibi beyindeki üst merkezlerden veya testisler ve böbrek üstü bezleri gibi organlardan kaynaklanan bozukluklar kan testleriyle saptanır. Bu hastalarda uygun hormon tedavileriyle yüzde 40'lara varan gebelik oranına ulaşılır. İmmünolojik İnfertilite yüzde 5 oranında görülür. Burada erkeğin vücudu kendi spermlerine zarar verici maddeler geliştirir. Nedeni tam olarak bilenemeyen böyle durumlarda ilaçla tedavi ve aşılama denenir. Son çare olarak ICSI (tüp bebek) yöntemi uygulanır. Genetik bozukluklarda en sık rastlanan sorun kromozom anomalisidir. Direkt bir tedavi yapılamayan bu hastalarda yardımcı üreme teknikleri kullanılır. Bazı ilaçlar kısırlığa yol açabilir. En sık problem çıkaran ilaçlar, kanser ve psikiyatri ilaçlarıdır. Sindirim bozukluğu, artrit, tansiyon ilaçlarının bir kısmı da üreme problemi yaratabilir. Bazen şiddetli enfeksiyonlar ve kullanılan ilaçlara bağlı olarak kısırlık görülebilir. Mümkünse ilaç kesilmeli veya değiştirilmelidir. Üreme organlarındaki enfeksiyonlar tedavi edilmezse, kronik iltihaplar sonucu kısırlık olur. Özellikle cinsel ilişki ile bulaşan hastalıklarda erkek ve kadında kısırlık görülebilir. En sık görülenler chlamydia ve gonore (bel soğukluğu) dur. Aslında zamanında doktora başvurulursa, teşhisi kolay ve tedavileri basittir. Sperm kanalı tıkanıklığı: Yumurtalıkta üretilmeye başlayan sperm testisten çıkarak epididime geçer. Ardından kasıktan prostata kadar giden sperm kanalı ve son idrar yolundan geçerek rahimde kadının yumurtasını döller. Sperm hücresinin katettiği bu mesafe, bir insanın 3 maraton koşusunu hiç durmadan yapmasına eşittir. Sperm yolundaki çeşitli tıkanıklıkların nedenleri, gelişme bozuklukları, iltihaplar ve reaksiyonlar, enfeksiyon, geçirilmiş ameliyat veya yaralanma olabilir. Bu nedenleri saptayarak, tedavisi mümkün olanların tamiri gerekir. Genellikle bir çözüm bulunur. Bazı durumlarda ise çare bulunamaz. Buna örnek doğuştan sperm kanalının hiç gelişmemiş olması verilebilir.