İstanbul Cumhuriyet Başsavcısı Aykut Cengiz Engin, o dönem Tuncay Güney'ın evinde yapılan aramalarda ele geçirilen belgeler de yer alan 'Ergenokon' yapılanmasının araştırılması için talimat verdi. İddiaya göre, dönemin Organize Suçlar Şube Müdürü Adil Serdar Saçan, konuya ilişkin inceleme yapmadı ve 1 yıl sonra da bilgi ve delil olmadığı gerekçesiyle dosyayı kapattı. Veli Küçük'ün evinde ele geçirilen iki belgede ise Saçan'ın aldığı rüşvetlerin yazılı olduğu ileri sürüldü.