Bu sezon yaşanan tüm sakatlıklar, yanlış tedavi iddiaları ve oyuncuların iyileşme süreleri gözleri sağlık kuruluna çevirdi.
Fenerbahçe'de sakatlar kervanına son olarak Roberto Carlos'un da katılması üzerine tüm gözler sağlık kuruluna çevrildi. Piyer Arzuman ve diğer sağlık ekibi sakat gelen oyuncuları iyileştirmekte başarılı olamadı. Ligin 12. haftasında sakatlanan Deniz Barış ve 23 Mayıs 2007'de ameliyat olan Appiah hala iyileşmedi. "Ameliyata gerek yok" denilen kaleci Serdar Kulbilge daha sonra operasyon geçirerek uzun süre takımdan ayrı kaldı. Ve son olarak da Roberto Carlos, tedavisinde yanlış ilaçlar kullanıldığını belirtip ülkesinde tedavi olmaya karar verdi.