Barrett hastalığında birden kanser olunmaz. Hastalar 2 yıllık aralıklarla uygun sayıda biyopsi alınarak izlenir. Bu, hastaların en çok korktuğu noktadır. Biyopsi yetersiz ve yanlışsa, 6 ayda bir ya da yıllık takip edilir. Hasta ile detaylı konuşarak kanser olasılığının azlığı vurgulanmalıdır. Barrett özefagusunda önce hafif ve sonra yüksek dereceli kanser öncesi hücreler (displazi) görülür. Hafif ya da düşük (low grade displazide) hastalar daha kısa periyotlarda izlenir. Yüksek dereceli displazi veya direkt kanser saptananlarda cerrahi düşünülmelidir.