INTERTOTO'ya katılmayı hak eden Trabzonspor, 2. kez bu kupada mücadele edecek. 1999-2000'de İntertoto'ya 3. turda başlayan Trabzon, Perigua'yı geçip 4. turda Hambur'a elenmişti. Bu kez 2. turdan başlayacak olan Bordo-Mavililer, Arnavutluk ve Hırvatistan takımlarının galibiyle 7-8 Temmuz' da karşılaşacak. Rövanş ise 14 ya da 15 Temmuz'da. Trabzon 3. turu da geçerse UEFA Kupası'na kalacak.