Dışişleri Bakanı Ali Babacan'dan AB Başmüzakereci görevinin alınmasının ardından, aynı bakanlığa bağlı olan AB Genel Sekreterliği de Başbakanlığa bağlandı. Resmi Gazete'de yayınlanan karara göre, Avrupa Birliği Genel Sekreterliği Başbakanlığa bağlandı. Egemen Bağış'ın AB'den sorumlu Devlet Bakanlığı'na atanmasıyla başlayan süreç de böylece tamamlanmış oldu. Başbakanlığa bağlanan Avrupa Birliği Genel Sekreterliği Devlet Bakanı Bağış sorumlu olacak.