Hızlı tren geliyor ama sorunları da beraberinde getiriyor. Ulaştırma Bakanı Binali Yıldırım'ın dediği gibi, hızlı treninin hizmete girmesi için aşılması gereken sorunlar var. Deneme sürüşlerinde tren Eskişehir Garı'na girdiğinde kan revan içinde kalıyor. Kuşlar, trene çarpıyor. Hızlı tren işleten ülkelerde bu sorun, kuşların zamanla güzergahlarını değiştirmesiyle aşılmış durumda. Bir başka sorun çocukların raylara koyduğu taşlar. TCDD'nin oluşturduğu ekip, köyleri dolaşıp halkı bilinçlendirmeye çalışıyor. Atatürk Orman Çiftliği arazisindeki hemzemin geçit sorunu da, hala varlığını koruyor. Buranın SİT alanı olması nedeniyle hala sorun hala çözülemedi.