Savcılığın, Ergenekon zanlısı olarak ifadesini aldığı Ferda Paksüt'ün sorgusunda sıra dışı iki yöntem kullandığı ortaya çıktı.
1- Kişi ve sızma koruması: Paksüt'ün kimlerle konuştuğu, tutanağa geçmedi. Savcılık böylelikle kimlerin Paksüt'ün konuşmalarına takıldığının deşifre olmasını engelledi.
2- Suçun tanımı yok: İstanbul Başsavcılığı, Ankara'ya gönderdiği talimat yazısında Paksüt hakkındaki soruşturmanın neden yürütüldüğünü bildirmedi. Sadece sorular gönderildi.