ATO Başkanı Sinan Aygün, Ergenekon soruşturması kapsamında gözaltına alındığı dönemde kendisine destek veren CHP Genel Başkanı Deniz Baykal'a teşekkür ziyaretinde bulundu. CHP Genel Merkezi'ndeki görüşmede Baykal desteğini sürdürdü ve "Sana güveniyorum. Bir şey çıkmayacağını bildiğim için sahip çıktım" dedi. Aygün'ün gözaltında tutulduğu dönemde Deniz Baykal ATO'yu ziyaret ederek, moral vermişti.