Eski İstanbul Üniversitesi Rektörü Kemal Alemdaroğlu ile eski Genelkurmay Başkanı Orgeneral İsmail Hakkı Karadayı arasında yaşanan ilginç bir telefon konuşması da iddianamede yer aldı. Karadayı ile Alemdaroğlu arasında 9 Şubat 2008'de yapılan görüşmede, Ahmet Necdet Sezer, yaşanan sürecin sorumlusu olarak gösteriliyor. Süleyman Demirel'in, dönemin hükümet ortağı ANAP Genel Başkanı Mesut Yılmaz tarafından yeniden seçilmesinin engellenmesi eleştiriliyor.