Dokunulmazlık nedeniyle bugüne dek hakim karşısına çıkarılamayan Mehmet Ağar için ikinci yargılama süreci sorunlu başladı. Danıştay, "suç işlemek için çete oluşturmak" tan yargılanması istenen Ağar'ın dosyasını Yargıtay'a göndermişti. Ancak Yargıtay Ağar'ın Susurluk dosyasını, "Suç tarihinde vali değil, emniyet müdürüydü" diyerek Ağır Ceza Mahkemesi'ne gönderdi.