Ergenekon'da ortaya çıkan bir başka bilgi de örgüt üyelerinin Başbakan Erdoğan'a suikast için DHKP-C ile irtibata geçtiği yönünde oldu.
İstanbul Terörle Mücadele ekipleri tarafınden geçen Mart 'ta Küçükçekmece'de bir eve baskın düzenlemiş, bir Kaleşnikof marka silah ve 35 kilo patlayıcı ile yasadışı DHKP-C militanları Özgür Barış Ö. ve Deniz Ş. yakalanmıştı.
KROKİLERİ ELE GEÇİRİLDİ 2 militanın bilgisayarları ile flash belleklerine de el konulmuştu. Flash belleklerde ise Başbakan Erdoğan'ın Üsküdar'daki evinin krokileri ele geçirilmişti. Krokilerin bombalı bir saldırı için hazırlandığı tespit edilmişti. Polis, son operasyonla Erdoğan'a düzenlenmek istenilen suikastin DHKP-C'ye, Ergenekon yöneticileri tarafından ihale edildiğini ortaya çıkardı. İddiaya göre Ergenekon yöneticileri, Erdoğan'a suikast için DHKP-C yöneticileriyle bağlantıya geçti. Bunun üzerine DHKP-C yöneticileri bomba ve suikast eğitimi alan 2 militanına bu görevi verdi.