10. Cumhurbaşkanı Sezer'in 9 maddesini veto ettiği, AB'nin çıkması için bastırdığı Vakıflar Yasası, CHP ve MHP'nin sert muhalefetine rağmen TBMM'den geçti. Tunceli Bağımsız Milletvekili Kamer Genç, tasarının patrikhanenin danışmanı tarafından hazırlandığını ileri sürdü. Başbakan Yardımcısı Hayati Yazıcı ise yasada Fener Rum Patrikhanesi ya da Ruhban Okulu ile ilgili bir düzenleme olmadığını belirterek, "Türkiye'de 161 cemaat vakfı vardır. Bu, 162 olmayacaktır" dedi. Görüşmeleri haftalardır süren yasa kapsamında, azınlık vakıflarına malları iade edilecek.