Köşk'e çıkan listede İçişleri Bakanı olarak Çiçek'in yer aldığı ancak Gül'ün Beşir Atalay'ı bu göreve kaydırdığı iddia edildi.
Büyük sürprizlere yer vermeyen yeni kabinenin tek sürprizi, İçişleri Bakanlığı'na kaydırılan, önceki hükümetin Devlet Bakanı Beşir Atalay oldu. AKP'de bile şaşkınlık yaratan karar, kulislere göre "Çankaya Köşkü'nde" alındı. İddialara göre, Köşk'e giden listede İçişleri Bakanı olarak Cemil Çiçek yer alıyordu. Ancak kendisine çok yakın olan Atalay'ı, Cumhurbaşkanı Gül tercih etti. Daha önce Milli Eğitim Bakanlığı'na getirilmek istenen Atalay'ın ismi Köşk'ten dönmüştü. Atalay'ın kendisine bağlı Jandarma Genel Komutanlığı nedeniyle askerlerle sık sık muhatap olacak olması, AKP'de "ileride sıkıntı yaşanabileceği" kaygısına yol açtı.