NATO yetkilileri, AB yetkilileriyle yaptığı bazı toplantılarda Türkiye'nin tepkisi ile karşılaştı. Öyle ki Türkiye kendisiyle ilgili NATO'daki önemli hususların, Kıbrıs'ın üye olduğu AB toplantılarında konuşulmasını istemiyor. Bu konuda tepkisini de her fırsatta gösteriyor. Kıbrıs da AB'nin Türkiye'nin kurucularından olduğu NATO ile yapılacak çalışmalara izin vermeyeceğini açıkladı. Hem AB hem de NATO, bu konuda çaresiz kaldı.