Vergi reformuna hazırlanan maliyenin, mükelleflere çeşitli nedenlerle sağladığı istisnalar nedeniyle bütçe gelirlerinin ortalama yüzde 10'undan vazgeçtiği hesaplandı. Vergi istisnaları olmasaydı, kamu kesimi borçlanma gereği de yüzde 20 azalacaktı. Yapılan bir araştırma, tahsil edilmeyen ve teşvik amacı güden vergi fedakarlığının 12.4 katrilyon lira (8.3 milyar dolar) düzeyinde olacağını gösterdi. Dr. Mehmet Özkara'nın yaptığı araştırma, 1997-2002 döneminde Gelir, Kurumlar ve KDV'de ölçülebilen vergi istisnalarının ekonomiye etkisini ortaya çıkardı. İstisnalar nedeniyle vazgeçilen tutar, Gelir Vergisi ve KDV'de fiilen mükellefe yansıyan ortalama vergi oranını yüzde 1.3, Kurumlar Vergisi oranını ise yüzde 15 aşağıya çekti. İstisna uygulamaları nedeniyle vazgeçilen vergiler, net bütçe gelirlerinin yüzde 10'unu buldu.
